La détection, généralement associée à la quantification des génomes viraux (ADN ou ARN du virus) constitue un élément essentiel du diagnostic direct en virologie. En effet, la présence du génome viral signe la multiplication du virus au niveau de son ou de ses organe(s) cible(s). Les méthodes de détection et de quantification des génomes viraux sont principalement fondées sur l'amplification de la cible (PCR pour "polymerase chain reaction" ou TMA pour "transcription-mediated amplification") ou sur l'amplification du signal (bDNA pour "branched DNA").
La détection et la quantification des ARN ou des ADN viraux sont réalisées à l'aide de techniques automatisées.
ANALYSE | INDICATION | AUTOMATE | REACTIF |
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Suivi thérapeutique de l’hépatite chronique B | GeneXpert |
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Diagnostic de réactivation CMV Suivi thérapeutique de l’infection par le CMV |
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Diagnostic de lymphoproliferation liée à l’EBV Suivi thérapeutique de l’infection par l’EBV |
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Diagnostic étiologique d’anémie chez les patients immunodéprimés Diagnostic étiologique d’anémie chez les patients atteints d'hémoglobinopathie |
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| Diagnostic étiologique des gastroentérites et des pneumopathies d’allure virale Diagnostic étiologique des infections sévères chez le patient immunodéprimé |
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Détections qualitatives multiples des génomes de virus respiratoires : virus respiratoire syncitial, metapneumovirus humain, rhinovirus/enterovirus, adenovirus, coronavirus, virus parainfluenza, virus influenza A (H1N1, H3N2) et B | Diagnostic étiologique des pneumopathies viral aiguës | Filmarray |
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Le laboratoire de Virologie dispose de plusieurs automates dédiés à la détection et à la quantification des génomes viraux :